Resumo:
A Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS) causada por um coronavírus (SARS-CoV-
2) ainda é uma infecção viral recente. Não há evidências científicas e ensaios clínicos que
indiquem que possíveis terapias tenham mostrado resultados em pacientes suspeitos ou
confirmados. Diante do exposto, algumas drogas estão sendo utilizadas e estudadas para
conter a propagação do vírus e os danos em toda a sociedade. Os medicamentos usados em
tratamentos alternativos incluem antimaláricos, antimicrobianos, corticosteroides
antivirais, anticoagulantes e soro convalescente. Portanto, a química medicinal tem
contribuído de forma multidisciplinar. Este trabalho teve como objetivo realizar uma
triagem de 2.108 medicamentos essenciais conhecidos e amplamente utilizados pela
população de modos a avaliar uma possível capacidade inibitória do COVID-19, se ligando
à protease principal Mpro
. Para isso foi aplicada a química computacional usando o
MolAiCalD com algoritmo de modelo Genético Lamarckiano (GA) combinado com a
estimativa de energia baseada em grade em conformação rígida e flexível. Os ligantes
escolhidos para realização da triagem virtual por docking molecular foram medicamentos
registrados no FDA e disponíveis na biblioteca virtual. Além disso, estudos de dinâmica
molecular também foram realizados para verificar a estabilidade no complexo receptor-
ligante formado por meio de análises de RMSD, RMSF, H-Bond, SASA e MMGBSA. Em
comparação com a energia de ligação da lixiviação sintética redocking (-6,8
kcal/mol/RMSD 1,34 Å), que foi bem acima, decidiu-se abordar os parâmetros de apenas
três ligantes, ergotamina (-9,9 kcal/mol/ RMSD de 2,0 Å), diidroergotamina (-9,8
kcal/mol/RMSD de 1,46 Å) e olísio (-9,5 kcal/mol/RMSD 1,5 Å). Pode-se afirmar que a
ergotamina apresentou as melhores interações com a protease Mpro do covid19 pelo estudo
in sílico, sendo um candidato promissor no tratamento do Covid19.
Descrição:
CALUACO, Bernardino Joaquim. Potenciais inibidores contra a protease Mpro do Sars-Cov-2: Docking Molecular, Dinâmica
Molecular, RMSD, RMSF, H-bond, SASA e aproximações MMGBSA. Monografia - Curso de Química, Instituto de Ciências Exatas e da Natureza, Universidade da Integração Internacional da Lusofonia Afro-brasileira, Redenção-Ceará, 2023.
